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核酸电泳相关试剂、缓冲液的配制方法50×TAE Buffer (pH8.5) ■ 组份浓度 2 M Tirs-醋酸,100 mM EDTA ■ 配制量 1 L ■ 配制方法 1. 称量下列试剂,置于 1 L 烧杯中。 Tris 242 g Na2EDTA·2H2O 37.2 g 2. 向烧杯中加入约 800 ml 的去离子水,充分搅拌溶解。 3. 加入 57.1 ml 的醋酸,充分搅拌。 4. 加去离子水将溶液定容至 1 L 后,室温保存。 10×TBE Buffer (pH8.3) ■ 组份浓度 890 mM Tirs-硼酸,20 mM EDTA ■ 配制量 1 L ■ 配制方法 1. 称量下列试剂,置于 1 L 烧杯中。 Tris 108 g Na2EDTA·2H2O 7.44 g 硼酸 55 g 2. 向烧杯中加入约 800 ml 的去离子水,充分搅拌溶解。 3. 加去离子水将溶液定容至 1 L 后,室温保存。 10×MOPS Buffer ■ 组份浓度 200 mM MOPS,20 mM NaOAc,10 mM EDTA ■ 配制量 1 L ■ 配制方法 1. 称量 41.8 g MOPS,置于 1 L 烧杯中。 2. 加约 700 ml DEPC 处理水,搅拌溶解。 3. 使用 2 N NaOH 调节 pH 值至 7.0。 4. 再向溶液中加入下列试剂。 1 M NaOAc(DEPC 处理) 20 ml 0.5 M EDTA(pH8.0)(DEPC 处理) 20 ml 5. 用 DEPC 处理水将溶液定容至 1 L。 6. 用 0.45 μm 滤膜过滤除去杂质。 7. 室温避光保存。 注:溶液见光或高温灭菌后会变黄。变黄时也可使用,但变黑时不要使用。 溴乙锭 (10 mg/ml) ■ 组份浓度 10 mg/ml 溴乙锭 ■ 配制量 100 ml ■ 配制方法 1. 称量 1 g 溴乙锭,加入到 100 ml 容器中。 2. 加入去离子水 100 ml,充分搅拌数小时完全溶解溴乙锭。 3. 将溶液转移至棕色瓶中,室温避光保存。 4. 溴乙锭的工作浓度为 0.5 μg/ml。 注意:溴乙锭是一种致癌物质,必须小心操作。 琼脂糖凝胶 ■ 配制方法 1. 配制适量的电泳及制胶用的缓冲液(通常是 0.5×TBE 或1×TAE)。 2. 根据制胶量及凝胶浓度,准确称量琼脂糖粉,加入适当的锥形瓶中。 3. 加入一定量的电泳缓冲液(总液体量不宜超过锥形瓶的50%容量)。 注:用于电泳的缓冲液和用于制胶的缓冲液必须统一。 4. 在锥形瓶的瓶口封上保鲜膜,并在膜上扎些小孔,然后在微波炉中加热熔化琼脂糖。加热过程中,当溶液沸腾后,请戴上防热手套,小心摇动锥形瓶,使琼脂糖充分熔化。此操作重复数次,直至琼脂糖完全熔化。必须注意,在微波炉中加热时间不宜过长,每次当溶液起泡沸腾时停止加热,否则会引起溶液过热暴沸,造成琼脂糖凝胶浓度不准,也会损坏微波炉。熔化琼脂糖时,必须保证琼脂糖充分完全熔化,否则,会造成电泳图像模糊不清。 5. 使溶液冷却至60℃左右,如需要可在此时溴乙锭溶液(终浓度 0.5 μg/ml),并充分混匀。 注:溴乙锭是一种致癌物质。使用含有溴乙锭的溶液时,请戴好手套。 6. 将琼脂糖溶液倒入制胶模中,然后在适当位置处插上梳子。凝胶厚度一般在 3~5 mm 之间。 7. 在室温下使胶凝固(大约 30 分钟~1 小时),然后放置于电泳槽中进行电泳。 注:凝胶不立即使用时,请用保鲜膜将凝胶包好后在 4℃下保存,一般可保存 2~5 天。 ■ 琼脂糖凝胶浓度与线形 DNA 的最佳分辨范围 琼脂糖浓度 最佳线形 DNA 分辨范围(bp) 0.5% 1,000~30,000 0.7% 800~12,000 1.0% 500~10,000 1.2% 400~7,000 1.5% 200~3,000 2.0% 50~2,000 6×Loading Buffer (DNA 电泳用) ■ 组份浓度 30 mM EDTA 36%(V/V) Glycerol 0.05%(W/V) Xylene Cyanol FF 0.05%(W/V) Bromophenol Blue ■ 配制量 500 ml ■ 配制方法 1. 称量下列试剂,置于 500 ml 烧杯中。 EDTA 4.4 g Bromophenol Blue 250 mg Xylene Cyanol FF 250 mg 2. 向烧杯中加入约 200 ml 的去离子水后,加热搅拌充分溶解。 3. 加入 180 ml 的甘油(Glycerol)后,使用 2 N NaOH调节 pH 值至 7.0。 4. 用去离子水定容至 500 ml 后,室温保存。 10×Loading Buffer (RNA 电泳用) ■ 组份浓度 10 mM EDTA 50%(V/V) Glycerol 0.25%(W/V) Xylene Cyanol FF 0.25%(W/V) Bromophenol Blue ■ 配制量 10 ml ■ 配制方法 1. 称量下列试剂,置于 10 ml 离心管中。 0.5 M EDTA(pH8.0) 200 μl Bromophenol Blue 25 mg Xylene Cyanol FF 25 mg 2. 向离心管中加入约 4 ml 的 DEPC 处理水后,充分搅拌溶解。 3. 加入 5 ml 的甘油(Glycerol)后,充分混匀。 4. 用 DEPC 处理水定容至 10 ml 后,室温保存。 |